[English-Español] IDENTIFICAN UN NUEVO VIRUS QUE AFECTA A LA VID EN LA ARGENTINA

Identify a new virus that affects the vine in Argentina Identify a new virus that affects the vine in Argentina It is a pathogen associated with red spot on the vine. Studies conducted by a team of researchers from the INTA determined its presence in the country and its potential to reduce the profitability of plantations and fruit quality. Along with the company Qualab offer laboratory tests to control it. Monday July 13, 2020 Thanks to the use of genomic tools and massive sequencing, a team of researchers from the INTA -made by specialists from the Experimental Agropecuaria Mendoza Station, Institute of Plant Pathology (IPAVE) and the Institute of biotechnology managed to characterize a virus that affects the wine industry worldwide. It is 'Grapevine red blotch virus' (GRBaV, for its acronym in English) and is associated with disease of the red stain of the vine, a condition that reduces the profitability of plantations and fruit quality. "To identify and characterize a virus is a complex task and involves the analysis of data from around the world," said Sebastián Gómez Talquenca, specialist in virology Vine INTA Mendoza, who warned that the symptoms that these viruses are very similar nutritional or physiological problems: "it is very common to see a red floor and think you have low potassium or phosphorus and, indeed, may be a pathological problem." Therefore, Gómez Talquenca working on developing tools to identify known viruses and characterization of those whose existence is unknown. "Thanks to this work articulated in the past two years, we describe a new viral species in the country," said researcher INTA, who articulates actions with Humberto Debat of the IPAVE and Diego Zavallo and Sebastian Asurmendi of the Institute of Biotechnology of the INTA. It is Grapevine red blotch virus (GRBaV, for its acronym in English), belongs to the Geminiviridae family and is associated with disease of the red stain of the vine, a condition that reduces the profitability of plantations and quality fruit. "While this disease was first reported in 2008 in plantations of California, recently we now describe and characterize the virus associated with this disease in Argentine vineyards," said Gómez Talquenca. According to initial reports, "in red grapes cultivars, foliar symptoms of illness consist of red spots early in the season that can expand and unite most of the leaf blade; while white grape cultivars, foliar symptoms of disease are less visible and usually involve irregular chlorotic areas that may become necrotic at the end of the season. " "We want to make known that this virus is present in plantations of Argentina for producers to understand what the damage it causes," said the specialist INTA who said that "the big problem with viral diseases in vine is which they are chronic and, while not kill the plant, the sick for the whole life ". In this sense, Gomez pointed Talquenca the economic impact caused by ignorance. "The vine is a plant that can last 25, 50 or even 100 years. This longevity, when plants have chronic infections derives a steady loss, year after year, caused by a virus and economic damage is very severe, "he said. Biotechnology Undoubtedly, the sequencing of the human genome (2003) was a milestone that revolutionized the approach to the study of DNA. His system was made possible by advances in methods used to analyze nucleic acids and to the development of increasingly sophisticated technologies sequencing. Access to sequencing technologies advanced generation (NGS, for its acronym in English), from 2007 onwards, not only yielded quickly and with great depth detail of the nucleotide sequence complete of an organism and understand your organization but it changed the approach to genomics. "The advancement of technology and tools such as bioinformatics, facilitated massive data analysis. In fact, in the last five years many new species were described, and today, we have 88 viral species described that infect the vine, "said the specialist INTA who stated:" This makes the vine on the ground that is host of the largest number of virus naturally. What is not bad for the plant, but for the market. " Knowledge and understanding of these pathogens can generate healthy materials. Therefore, "our work is aimed at studying the viruses that are present in the Argentine plants to characterize and determine which affect productivity and which are not," said Gómez Talquenca. Joint public-private Know what viruses are present in the Argentine vineyards, it is not a simple task. To advance this research, INTA specialists work together with the Institute of Wine Catena. "The goal of the joint is not only to identify the viral species that circulate and cause damage to production, but also are committed to produce virus-free plants," said Gómez Talquenca. In addition, together with the company Qualab developed the necessary technology for the analysis and diagnosis of the virus. "Qualab is a company incubated within the INTA with the vision to save the wine industry," said researcher INTA and added: "Through an agreement of technological linkage, Qualab helps producers identify the pathogens responsible for viral diseases sustainability in the industry. "

Identifican un nuevo virus que afecta a la vid en la Argentina Identifican un nuevo virus que afecta a la vid en la Argentina Se trata de un patógeno asociado a la mancha roja de la vid. Estudios realizados por un equipo de investigadores del INTA determinó su presencia en el país y su potencial capacidad de disminuir la rentabilidad de las plantaciones y la calidad de la fruta. Junto con la empresa Qualab ofrecen análisis de laboratorio para controlarlo. lunes 13 de julio de 2020 Gracias al uso de herramientas genómicas y de secuenciación masiva, un equipo de investigadores del INTA –integrado por especialistas de la Estación Experimental Agropecuaria Mendoza, del Instituto de Patología Vegetal (IPAVE) y del Instituto de Biotecnología– logró caracterizar un virus que afecta a la vitivinicultura de todo el mundo. Se trata de 'Grapevine red blotch virus' (GRBaV, por sus siglas en inglés) y está asociado a la enfermedad de la mancha roja de la vid, una afección que disminuye la rentabilidad de las plantaciones y la calidad de la fruta. "Identificar y caracterizar un virus es una tarea compleja e implica el análisis de datos provenientes de todo el mundo", expresó Sebastián Gómez Talquenca, especialista en virología de la vid del INTA Mendoza, quien advirtió que los síntomas que presentan estos virus son muy similares a problemas nutricionales o fisiológicos: "Es muy común ver una planta roja y pensar que tiene deficiencia de potasio o fosforo y, en realidad, puede tratarse de un problema patológico". Por esto, Gómez Talquenca trabaja en el desarrollo de herramientas que permitan la identificación de los virus conocidos y la caracterización de aquellos cuya existencia se desconoce. "Gracias a este trabajo articulado, en los últimos dos años, describimos una nueva especie viral en el país", indicó el investigador del INTA, quien articula acciones con Humberto Debat del IPAVE y Diego Zavallo y Sebastian Asurmendi del Instituto de Biotecnología del INTA. Se trata de Grapevine red blotch virus (GRBaV, por sus siglas en inglés), pertenece a la familia Geminiviridae y está asociado a la enfermedad de la mancha roja de la vid, una afección que disminuye la rentabilidad de las plantaciones y la calidad de la fruta. "Si bien esta enfermedad fue informada por primera vez en 2008 en plantaciones de California, recién ahora pudimos describir y caracterizar el virus asociado a esta patología en viñedos argentinos", señaló Gómez Talquenca. Según los primeros reportes, "en los cultivares de uvas tintas, los síntomas de la enfermedad foliar consisten en manchas rojas a principios de la temporada que pueden expandirse y unirse en la mayor parte de la lámina de la hoja; mientras que en los cultivares de vid blancas, los síntomas de la enfermedad foliar son menos visibles y, generalmente, involucran áreas cloróticas irregulares que pueden volverse necróticas al final de la temporada". "Queremos dar a conocer que este virus que está presente en las plantaciones de la Argentina para que los productores entiendan cuál es el daño que provoca", indicó el especialista del INTA quien aseguró que "el gran problema que tienen las enfermedades virales en vid es que son crónicas y, si bien no matan a la planta, la enferman para toda su vida útil". En este sentido, Gómez Talquenca puntualizó en el impacto económico que provoca el desconocimiento. "La vid es una planta que puede durar 25, 50 o hasta 100 años. Esta longevidad, cuando las plantas tienen infecciones crónicas, deriva en una pérdida constante, año tras año, provocada por un virus y el daño económico es muy severo", señaló. Biotecnología Sin dudas, la secuenciación del genoma humano (2003) fue un hito que revolucionó la manera de abordar el estudio del ADN. Su ordenamiento fue posible gracias a los avances en métodos usados para analizar ácidos nucleicos y al desarrollo de tecnologías cada vez más sofisticadas de secuenciación. El acceso a las tecnologías de secuenciación de generación avanzada (NGS, por sus siglas en inglés), desde 2007 en adelante, no solo permitió obtener de manera rápida y con gran profundidad el detalle de la secuencia nucleotídica completa de un organismo y comprender su organización, sino que modificó la manera de abordar la genómica. "El avance de la tecnología y de herramientas, como la bioinformática, facilitó el análisis masivo de datos. De hecho, en los últimos cinco años se describieron muchísimas especies nuevas y, al día de hoy, tenemos 88 especies virales descriptas que infectan a la vid", aseguró el especialista del INTA quien puntualizó: "Esto convierte a la vid en la planta que es huésped del mayor número de virus en forma natural. Lo que no es malo para la planta, sino para el mercado". El conocimiento y entendimiento de estos patógenos, permite generar materiales sanos. Por esto, "nuestro trabajo está dirigido a estudiar los virus que están presentes en las plantas argentinas para caracterizarlos y determinar cuáles afectan a la productividad y cuáles no", expresó Gómez Talquenca. Articulación público-privada Conocer cuáles son los virus que están presentes en los viñedos argentinos, no es una tarea sencilla. Para avanzar en esta línea de investigación, los especialistas del INTA trabajan junto con el Catena Institute of Wine. "El objetivo de la articulación no es sólo identificar las especies virales que circulan y causan daño a la producción, sino que, además, apostamos a producir plantas libres de virus", afirmó Gómez Talquenca. Además, junto con la empresa Qualab desarrollaron la tecnología necesaria para el análisis y diagnóstico de los virus. "Qualab es una empresa incubada dentro del INTA con la visión de salvar a la vitivinicultura", aseguró el investigador del INTA y agregó: "Mediante un convenio de vinculación tecnológica, Qualab ayuda a los productores a identificar los patógenos responsables de enfermedades virales que afectan su sostenibilidad en la industria".